百花生物集團公司下有全資子公司山東菏澤百花生物科技有限公司、山東菏澤地益生物科技有限公司、青島根實生物科技有限公司、北京市綠泉科技發展有限公司、煙臺沃土生物科技有限公司、山東單縣大衣哥生物科技有限公司。